NICEATM更新ICE化學品資訊分析整合平台3.1版



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更新日期:2020-07-27

       美國國家毒物計畫替代性毒理學方法跨部門評估中心(The National Toxicology Program (NTP) Interagency Center for the Evaluation of Alternative Toxicological Methods, NICEATM)於7月20日發布「ICE化學品資訊分析整合平台 (Integrated Chemical Environment, ICE)」3.1版的更新。ICE 3.1版為「化學物質搜尋」 (Chemicals Search)、「化學物質特徵描述」 (Chemical Characterization)與「體外體內推估」 (In vitro to in vivo extrapolation, IVIVE)等工具增添了新的功能,並加上更新資料以及化學物質快速選單。

提高透明度:

  • 下載的Excel檔案包含元資料(Metadata),解釋各個工作表內容與縮寫用語。
  • 下載的cHTS(Curated high-throughput screening)總結檔案包含只有數字的資料,以便將查詢結果轉至其他工作處理流程。
  • 「搜尋」功能中的「試驗選擇」(Select Assatys)對話框提供了資訊按鈕與改良的編構方式,以便辨識試驗類型。

更新資料:

  • 測量的吸收、分布、代謝、排泄(ADME)參數值。
  • 增加新的化學物質快速選單:
    1. 美國環境保護署(US EPA):活性成分(Active ingredients)清單。
    2. 美國環境保護署(US EPA):食用和非食用之惰性成分(Inert ingredients)清單。

新增功能:

  • 使用者可將「化學物質搜尋」(化學物質或混合物)的搜尋結果傳送到美國環境保護署化學結構資料庫(U.S. EPA Chemistry Dashboard)。
  • 「化學物質特徵描述」工具的PCA製圖可以讓使用者的化學物質清單與Tox21、ICE的化學物質進行視覺化的比較。
  • 「體外體內推估」(IVIVE)工具包含體外試驗(in vitro)的選擇,並可利用體外試驗的作用機制(Mode of action, MOA)註解來進行篩選。

資料來源:ICE updates-ICE 3.1 Release Notes

網路講座:「ICE化學品資訊分析整合平台 - 支援毒性評估的工具與數據」(CC英語字幕)

相關資源-分析工具:「化學品資訊分析整合平台」(ICE)

 

編譯:徐如欣 研究助理、鄭獻仁 博士/兼任助理教授

校稿:鄭獻仁 博士/兼任助理教授、林嬪嬪 研究員/代理所長